《黑客帝国》 华纳家庭影象一区PAL单碟装vs. 华纳家庭影象一，四区NTSC《黑客帝国》终极收藏版五碟装碟一

发行的版本有明显的区别：04版画面清晰度和对比度更高，很可能是采用了高清晰素材制作的。画面影象也有些不同，04版部分画面上下两边或者角落处表现了更多的影象。使得两个版本面看起来有很大区别（详见截图1，4）。

另外一点不同在色彩上：99版画面在黑客世界是棕绿色调，在真实世界是淡蓝色调；04版中黑客世界的色调以很自然的浅绿色调为主，而真实世界是以更浅的蓝白色调为主。这样一来，这个版本比99版的色调与《黑客帝国2》和《黑客帝国3》更一致。当然，由于04版的画面对比更好，因此很容易看出这些方面的不同。但是99版的色彩也不差，所以也不说04版在色彩上有多大的进步，而且由于后面的续集并没有获得什么好评，使之与第一部相比，更像是个败笔。 无论如何， Wachowski本来就是打算以这样的色彩表现这部影片，因此这到底是不是品位的问题，就要根据影片的真实效果来判断了。

花絮部分，04终极收藏版收录了99版中评论之外的所有花絮，他们用新的评论代替了原来的评论，尽管新的评论不是很令人满意。另外04版增加了法语配音（绝对是法语配音而不是包装上说的魁北克配音）和法语字幕这一点是很棒的。